Nel 1672 nelle isole Marianne i missionari gesuiti stavano evangelizzando la popolazione locale, ottenendo grande successo, ma i guaritori locali, invidiosi del seguito che gli “stranieri” avevano saputo acquistarsi, si inventarono che l’acqua con cui erano battezzati i bambini era avvelenata.

Il clima diventò teso e fu Pedro, insieme a Padre Diego Luis de San Vitores, a farne le spese: infatti, viene ferito in pieno petto e ucciso a colpi di scimitarra.